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| type
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| Thesis advisor
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| Praeses
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| Author
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| alternative label
| - Functional analysis of the GUN1 protein, its partners and their roles in the retrograde signals of the chloroplast
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| dc:subject
| - Expression des gènes
- Thèses et écrits académiques
- Chloroplastes
- Organites
- ARN des chloroplastes
- Protéine à motif pentatricopeptide
- Protéines à motif de reconnaissance de l'ARN
- Reconnaissance motif ARN
- Signaux retrogrades du chloroplaste
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| preferred label
| - Analyse fonctionnelle de la protéine GUN1, de ses partenaires et de leurs rôles dans les signaux rétrogrades du chloroplaste
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| Language
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| Subject
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| dc:title
| - Analyse fonctionnelle de la protéine GUN1, de ses partenaires et de leurs rôles dans les signaux rétrogrades du chloroplaste
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| Degree granting institution
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| Opponent
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| note
| - Les organites, les plastes et les mitochondries sont les principaux sites du métabolisme énergétique au sein des cellules eucaryotes et sont à ce titre au cœur du métabolisme des plantes. Suite aux endosymbioses ancestrales qui les ont engendrées, les organites ont perdu une grande partie de leurs génomes d'origine. La plupart des protéines nécessaires à leur activité sont codées dans le noyau. Cependant, ils ont conservé de petits génomes codant pour des protéines clés et des ARN nécessaires à leur biologie.De nombreux facteurs nécessaires à l'activité des organites doivent être importés dans leur compartiment d'origine, ce qui nécessite de fait une coordination entre l'expression du génome nucléaire et celui des organites. Cette coordination repose sur des voies de signalisation antérograde et rétrograde entre le noyau et le chloroplaste. Les voies antérograde (du noyau au chloroplaste) résident principalement dans l'adressage au chloroplaste de protéines codées par le noyau. Les voies de signalisation rétrogrades (du chloroplaste au noyau) sont encore mal caractérisées mais la protéine GUN1 a été identifiée comme en étant l'une des principales composantes. Cependant, le rôle exact de GUN1 dans la signalisation rétrograde reste à ce jour non caractérisé. GUN1 est une protéine pentatricopeptide répétée (PPR). Les protéines PPR sont presque exclusivement adressées aux mitochondries et/ou aux chloroplastes où elles sont impliquées dans toutes les étapes de l'expression des gènes, de la transcription à la traduction. Les protéines PPR sont spécialisées dans les interactions avec les ARN avec lesquels elles se lient de manière séquence spécifique. De ce fait,les PPR occupent des fonctions spécifiques médiées par leur interaction à un élément cis au sein d'un ou de plusieurs ARN spécifique(s). Ainsi, la caractérisation fonctionnelle de ces protéines nécessite l'identification de leur(s) site(s) de liaison à l'ARN. En couplant des approches d'analyse phylogénétique et bioinformatique, nous avons pu identifier une cible ARN putative pour la PPR GUN1. Cette cible putative est située au centre de la peptidyltransférase du ribosome, à l'extrémité 3' de l'ARNr du 23S. de façon intéressante, nous avons pu identifier un défaut potentiel associé à ces ARN lorsque la signalisation rétrograde du plaste est altérée. La caractérisation des conséquences moléculaires observées chez les mutants gun1 nécessite des investigations complémentaires ; néanmoins, ces nouvelles informations sur les mutants gun1 pourraient expliquer la majorité des résultats publiés à ce sujet.
- The organelles plastids and mitochondria are the main sites of energy metabolism within eukaryotic cells and as such are at the core of plant metabolism. Subsequent to the ancestral endosymbioses that gave rise to them, organelles have lost much of their original genomes. Most of the proteins required for their activity are encoded in the nucleus. However, they have retained small genomes encoding key proteins and RNAs necessary for their biology. Many of the factors required for organelle activity need to be targeted back to their original compartment, creating a requirement for coordinated regulation of nuclear and organellar gene expression. This coordination implies anterograde and retrograde signalling pathways between the nucleus and the chloroplast.The anterograde pathway (from the nucleus to the chloroplast) is mainly based on the nucleus encoded proteins targeted to the chloroplast. The retrograde pathway (from the chloroplast to the nucleus) is still poorly characterized but the GUN1 protein has been identified as one of the main components. However the role of GUN1 in retrograde signalling remains elusive. GUN1 is a pentatricopeptide repeat (PPR) protein. PPR proteins are almost exclusively targeted to mitochondria and/or chloroplasts where they are involved in all steps of gene expression from transcription to translation. PPR proteins interact specifically with sequence motifs in RNA molecules. Potentially each PPR protein has a specific function in a specific RNA processing step via this ability to bind a specific RNA cis-element. Thus, the functional characterization of these proteins requires the identification of their RNA binding site(s). By coupling phylogenetic and bioinformatic approaches, we could identified a putative RNA binding site for the GUN1 PPR protein. This putative target is located in the peptidyltranferase center of the ribosome, on the 3' end of the 23S rRNA. Interestingly, we could identify a potential default associated with these RNAs when the plastid retrograde signaling is impaired. The characterization of the molecular consequences observed in the gun1 mutants needs further investigations ; nevertheless, these new informations on gun1 mutants could explain the majority of the results published on this subject.
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| http://iflastandar...bd/elements/P1001
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| rdaw:P10219
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| is primary topic
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| is rdam:P30135
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