About: Etude comparative de trois techniques de génotypage de la protéase et de la transcriptase inverse du VIH-1   Goto Sponge  NotDistinct  Permalink

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dc:subject
  • Centre hospitalier régional et universitaire
  • Transcriptase inverse
  • Thèses et écrits académiques
  • Génotype
  • VIH (virus)
  • Antirétroviraux
  • Résistance aux substances -- Dissertation universitaire
  • Protéase du VIH -- Dissertation universitaire
preferred label
  • Etude comparative de trois techniques de génotypage de la protéase et de la transcriptase inverse du VIH-1
Language
Subject
dc:title
  • Etude comparative de trois techniques de génotypage de la protéase et de la transcriptase inverse du VIH-1
Degree granting institution
note
  • Trente ans après l'émergence de l'épidémie du VIH, des progrès considérables ont été réalisés dans le domaine de la prise en charge thérapeutique, et notamment grâce au génotypage de résistance VIH. L'objectif de notre étude a été de comparer trois techniques de génotypage (2 commerciales Trugene™ et ViroSeq™, et la technique ANRS) du gène de la protéase et de la transcriptase inverse du VIH-1. Cette étude a été menée de novembre 2014 à avril 2015 au laboratoire de Virologie du CHU d’Amiens. Nous avons inclus, de manière non randomisée, 161 échantillons issus de 78 patients provenant du CHU d’Amiens et des centres hospitaliers périphériques. Notre comparatif s'est porté sur différents critères techniques et interprétatifs. Les techniques commerciales bénéficient d’une meilleure sensibilité pour l’amplification des séquences en raison d’un nombre d’amorces plus important. Cependant le temps technique requis pour leur réalisation reste important et l’impact financier non négligeable. Nos résultats montrent cependant une bonne concordance entre les trois techniques: pour le gène de la protéase nous avons obtenu une concordance de 99,55% et pour le gène de la transcriptase inverse une concordance de 99,47% n'ayant pas d'impact sur la prise en charge thérapeutique. Nous avons finalement décidé de travailler avec la technique ViroSeq™. Ce choix est basé sur plusieurs critères. Le principal étant sa vérification de méthode en portée A qui facilite l'accréditation, malgré un coût et un temps technique non négligeables.
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  • Text
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  • 2016
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