| Attributes | Values |
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| type
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| Thesis advisor
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| Author
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| alternative label
| - Genetic hypervariability in streptomyces ambofaciens : plasticity of a genomic arc
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| dc:subject
| - ADN
- Variabilité génétique
- Thèses et écrits académiques
- Streptomyces ambofaciens
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| preferred label
| - Hypervariabilité génétique chez streptomyces ambofaciens, Plasticité d'un arc génomique
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| Language
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| Subject
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| dc:title
| - Hypervariabilité génétique chez streptomyces ambofaciens, Plasticité d'un arc génomique
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| Degree granting institution
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| note
| - La souche sauvage de streptomyces ambofaciens dsm40697 présente une forte instabilité génétique produisant spontanément des colonies dépigmentées à la fréquence de 0,01. Alors que 13% des colonies dépigmentées ont une descendance de phénotype mutant, 87% présentent une descendance hétérogène sans phénotype majoritaire. Ce nouvel aspect de l'instabilité génétique a été appelé hyper variabilité. Des séquences d'ADN amplifiées (ads#1) ont été détectées dans 21% des colonies isolées à partir de descendances hypervariables, tandis qu'aucun cas d'amplification n'a été décelé ni dans les colonies dépigmentées stables ni dans les colonies sauvages. Donc, l'hyper variabilité et l'amplification sont associées. La taille des unîtes d'ADN amplifiable (aud#2) varie de 5,2 à 105 kb et le degré d'amplification est très variable suivant les souches. L'analyse de 48 ads isolées indépendamment a permis de caractériser au moins deux loci amplifiables non chevauchants (aud6 et aud90) à l'origine de plus de 73% des cas d'amplification. Les autres AUD n'ont pu être regroupées. La structure du locus de l'aud6 a été recherchée par analyse classique dans le génome sauvage: l'aud est présenté en copie unique et aucune longue répétition n'a pu être détectée aux extrémités. L'étude du locus de l'aud6 dans les souches mutantes a permis de corréler l'instabilité génétique à la formation de délétions. En effet, 35% de souches mutantes non amplifiées isolées à partir de lignées stables et hypervariables contiennent des délétions partielles ou totales de l'aud6. Le processus de délétion révèle une polarité. Ainsi, l'aud6 constitue un locus sujet à de fréquents remaniements génomiques (amplifications et multiples délétions). De plus, des délétions successives pourraient être impliquées dans le processus de desamplification. L'analyse en électrophorèse en champs pulsés (pfge#3) du génome sauvage à perm.
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