About: Développement d'outils de résolution de structure à haut débit

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An Entity of Type : rdac:C10001, within Data Space : data.idref.fr associated with source document(s)

Attributes	Values
type	frbr:Work rdac:C10001
Thesis advisor	Abergel, Chantal (19..-.... ; chercheur en génomique) École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
Author	Claude, Jean-Baptiste (1977-....)
alternative label	Tools creation for high throughput structure solving
dc:subject	Peptidases Thèses et écrits académiques Cristallographie Biologie du développement Structure moléculaire
preferred label	Développement d'outils de résolution de structure à haut débit
Language	http://lexvo.org/id/iso639-3/eng http://lexvo.org/id/iso639-3/fra
Subject	http://www.idref.fr/027674150/id http://www.idref.fr/027576809/id http://www.idref.fr/027253139/id http://www.idref.fr/028144171/id http://www.idref.fr/027576132/id
dc:title	Développement d'outils de résolution de structure à haut débit
Degree granting institution	Université Aix-Marseille II (1969-2011)
note	La résolution de structures des protéines par cristallographie aux rayons X connaît une croissance fulgurante avec le lancement des grands projets de génomique structurale. Dans un premier temps, nous avons résolu à 2 Ǻ la structure de la protéine yhbO d'Escherichia coli , dans le cadre d'un projet de génomique structurale, le projet ASG. L'étude structurale et bioinformatique d'yhbO permet de mieux comprendre sa place au sein de la vaste famille DJ-1/ThiJ/PfpI, et plus largement au sein de la superfamille des glutamines amidotransférases. La protéine yhbO est probablement une protéase à cystéine, comme la protéine PfpI de Pyrococcus horikoshii, son plus proche homologue structural. Dans un second temps, nous avons mis en place et développé CaspR, un serveur qui propose de résoudre les structures cristallographiques par la méthode du remplacement moléculaire. CaspR est capable de tester un très grand nombre de structures de façon entièrement automatique. En utilisant la modélisation par homologie, il est possible de générer une grande variété de modèles, qui sont automatiquement testés en remplacement moléculaire et en affinement. La génération de modèles multiples associée à des troncations choisies permet de résoudre des structures, même avec des homologues lointains (entre 20% et 35% d'identité de séquence).
dc:type	Text
http://iflastandar...bd/elements/P1001	http://iflastandards.info/ns/isbd/terms/contentform/T1009
rdaw:P10219	2007
has content type	http://rdaregistry.info/termList/RDAContentType/1020
is primary topic of	http://www.idref.fr/247503754
is rdam:P30135 of	http://www.sudoc.fr/122117069/id http://www.sudoc.fr/247019119/id

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