| Attributes | Values |
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| type
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| Thesis advisor
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| Author
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| alternative label
| - Study of the activation mechanism of MalT, a STAND signalling protein
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| dc:subject
| - Thèses et écrits académiques
- Transduction du signal -- Dissertation universitaire
- Multimérisation de protéines -- Dissertation universitaire
- Protéines Escherichia coli -- métabolisme -- Dissertation universitaire
- Maltose -- Dissertation universitaire
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| preferred label
| - Etude du mécanisme d’activation de MaIT, une protéine signalisatrice de type STAND
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| Language
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| Subject
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| dc:title
| - Etude du mécanisme d’activation de MaIT, une protéine signalisatrice de type STAND
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| Degree granting institution
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| note
| - The STAND proteins (Signal Transduction with Numerous ATPase domains) represent a family of sophisticated signalling proteins that was defined by Leipe et al. in 2004. These proteins, which are widespread in the three kingdoms of life, often control fundamental physiological processes. The STAND proteins function as a strictly regulated ADP/ATP switches. The ADP-bound form is an inactive monomeric form, while the ATP-bound form is a multimeric form responsible for downstream signalling. One of the masterpieces of the switch is the NOD module (nucleotide olimerization domain), which switches between an ADP-bound closed state and an ATP-bound open state. The mechanism of activation is still rather blurred on molecular level. STAND activation requires inducer binding to their sensor domain. To further characterize the role of the inducer, I used a bacterial STAND protein as a model system, the protein MalT, a transcriptional activator of the maltose regulon in Escherichia colt. Using biochemical and genetic approaches, I dissected the activation pathway and identified the step(s) that is (are) favored by the binding of maltotriose, the inducer of MalT. Notably, I found that actually it plays a dual role. First, it promotes the opening of the ADP-bound NOD module (the rsting form), thereby promoting nucleotide exchange. This role would be conserved throughout the STAND family. Second, the inducer makes the MaIT multimer competent for binding promoter MaIT site via its DNA-binding domain. I then developed a structural approach to understand how the inducer stimulates the promoter binding step.
- Les protéines STAND (pour « Signal Transduction ATPase with numerous domains ») représentent une famille de protéines signalisatrices très sophistiquées qui a été définie par Leipe et al. en 2004. Ces protéines, qui sont largement répandues dans trois règnes du vivant, contrôlent souvent des processus physiologiques fondamentaux couvrant un large éventail d'activités cellulaires. Les protéines STAND fonctionnent comme des commutateurs binaires ADP/ATP strictement régulés. La forme liée à l'ADP est une forme monomérique inactive alors que la forme liée à l'ATP est une forme multimérique active. L'une des pièces maîtresses du commutateur est le module NOD (pour « nucléotide oligomerization domain »), qui oscille entre un état fermé lié à l'ADP et un état ouvert lié à l'ATP. L'activation des STANDs requiert la fixation de l'inducteur sur leur domaine senseur.Pour mieux caractériser le rôle de l'inducteur, j'ai utilisé une protéine STAND bactérienne comme système modèle, il s'agit de la protéine MalT, un activateur transcriptionnel du régulon maltose d'Escherichia colt. En utilisant des approches génétique et biochimique, j'ai caractérisé les étapes du processus d'activation et identifié celles qui sont favorisées par la fixation du maltotriose, l'inducteur de MalT. J'ai notamment démontré que ce dernier avait en fait un double rôle. D'une part, il favorise l'ouverture du module NOD lié à l'ADP, favorisant ainsi l'échange nucléotidique. Ce rôle serait conservé chez les STANDs. D'autre part, l'inducteur rend le multimère formé par MaIT compétent pour la fixation des boîtes MaIT présentes dans le promoteur cible via son domaine de fixation à l'ADN. J'ai ensuite développé une approche structurale pour mieux comprendre comment l'inducteur stimule l'étape de fixation à l'ADN.
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