| Attributes | Values |
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| type
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| Thesis advisor
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| Author
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| alternative label
| - Search for specific markers of two species of the genus Lolium, L. perenne L. and L. multiflorum Lam
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| dc:subject
| - Lolium
- Thèses et écrits académiques
- Marqueurs biologiques
- Homologie
- Sciences biologiques fondamentales et appliquees. psychologie
- Agronomie. sciences du sol et productions vegetales
- Clonage moleculaire
- Sequencage
- Polymorphisme
- Comparaison interspecifique
- ADN -- Amplification
- Lolium multiflorum
- Lolium perenne
- Marqueur rapd
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| preferred label
| - Recherche de marqueurs spécifiques de deux espèces du genre Lolium, L. perenne L. et L. multiflorum Lam
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| Language
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| Subject
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| dc:title
| - Recherche de marqueurs spécifiques de deux espèces du genre Lolium, L. perenne L. et L. multiflorum Lam
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| Degree granting institution
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| note
| - We used the rapd (random amplified polymorphic DNA) technique on several varieties of lolium multiflorum lam. and l. Perenne l., in order to detect possible interspecific polymorphism and to develop amplified regions of known sequence (scar). In a first step, we sorted primers generating polymorphic profiles between these species, on mixtures of individuals. In order to determine whether the absence or presence of a marker after amplification of DNA from a mixture of individuals is really specific, i.e. whether a marker amplified from a mixture of individuals is found in all individuals of this species or whether its absence after amplification of DNA from a mixture of individuals means its absence in all individuals of this mixture, the individual representation of these markers was studied in two varieties: l. Perenne l. Var. Baltic and l. Multiflorum lam. Var. Wewo westerworld. The DNAs of 34 individuals of each variety were amplified by rapd. Hybridizations were performed to increase the sensitivity of the detection of the amplification products and to verify the sequence homology between fragments of the same size. We were thus able to estimate the degree of representation of these potential markers in these two varieties. Finally, 6 of the 11 markers selected were found to be non-specific to the species studied. For the other five markers, the results of the planting work indicate specificity in the analysis sample. The sequence homology of two markers specific to the species studied, oph-18 550 bp and oph-18 512 bp, led us to clone and sequence these markers. From the sequences obtained, a pair of primers was derived, allowing the amplification of oph-18 550 bp and oph-18 512 bp. These primers were used in pcr to verify the specificity of the markers on a larger number of varieties.
- Nous avons utilisé la technique rapd (ADN polymorphe amplifie au hasard) sur plusieurs variétés de lolium multiflorum lam. Et de l. Perenne l., dans le but de détecter un éventuel polymorphisme interspécifique et de développer des régions amplifiées de séquence connue (scar). Dans un premier temps, nous avons trie les amorces générant des profils polymorphes entre ces espèces, sur des mélanges d'individus. Afin de déterminer si l'absence ou la présence d'un marqueur après amplification d’ADN issu d'un mélange d'individus est vraiment spécifique, c'est-à-dire si un marqueur amplifie à partir d'un mélange d'individus se retrouve chez tous les individus de cette espèce ou si son absence après amplification d’ADN issu d'un mélange d'individus signifie son absence chez tous les individus de ce mélange, la représentation individuelle de ces marqueurs a été étudiée dans deux variétés : l. Perenne l. Var. Baltic et l. Multiflorum lam. Var. Wewo westerworld. Les ADN des 34 individus de chaque variété ont été amplifies par rapd. Nous avons réalisé des hybridations afin d'accroitre la sensibilité de la détection des produits d'amplification et de vérifier l'homologie de séquence entre fragments de même taille. Nous avons ainsi pu estimer le degré de représentation de ces marqueurs potentiels dans ces deux variétés. Finalement, 6 des 11 marqueurs retenus se sont révélés non spécifiques des espèces étudiées. En ce qui concerne les cinq autres marqueurs, les résultats du travail effectue en plante a planté indiquent une spécificité, dans l'échantillon analyse. L'homologie de séquence de deux marqueurs spécifiques des espèces étudiées, oph-18 550 pb et oph-18 512 pb nous a conduit à cloner et séquencer ces marqueurs. A partir des séquences obtenues, un couple d'amorce a été dérivé, permettant l'amplification de oph-18 550 pb et oph-18 512 pb. Ces amorces ont été utilisées en pcr afin de vérifier la spécificité des marqueurs sur un plus grand nombre de variétés.
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| http://iflastandar...bd/elements/P1001
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