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Pseudomonas putida Organisation gène Psychrotrophie Dégradation biologique Polluant Composés aromatiques -- Biodégradation Bioremédiation Pollution Sols -- Pollution Thèses et écrits académiques Gène EBD Mutagenèse Pseudomonas Toluène Voie métabolique Bactéries Température -- Effets physiologiques
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Etude biochimique et génétique d'une voie de dégradation des composés aromatiques par la souche psychrotrophe Pseudomonias putida 01G3, influence de la température de croissance sur les capacités dégradatives
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Etude biochimique et génétique d'une voie de dégradation des composés aromatiques par la souche psychrotrophe Pseudomonias putida 01G3, influence de la température de croissance sur les capacités dégradatives
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Sept souches de Pseudomonas ont été isolées à partir d'un sol pollué par du toluène pour leur capacité à dégrader ce composé à 10\c. Parmi celles-ci, la souche Pseudomonas putida 01g3 qui degrade le toluène à 4\c a été sélectionnée. La première partie de l'étude concerne la recherche de la voie de dégradation par des analyses physiologiques. Celle-ci est initiée par une dioxygénase périphérique proche de la toluène dioxygénase de p. Putida f1 (souche mésophile) et l'ouverture du cycle aromatique est réalisée par une catéchol 2,3-dioxygénase. La seconde partie a concerné la caractérisation génétique de la voie catabolique du toluène. Des expériences de mutagenèse avec le transposon mini-tn5lacz1 ont permis d'isoler 15 mutants tol . Les différents gènes ebd ont été clonés en deux fragments et séquences afin d'établir l'organisation génétique. Le premier renferme le gène ebdr dont le produit est une protéine de régulation positive impliquée dans la dégradation des alkylbenzènes. La seconde séquence renferme 6 orf dont les protéines putatives sont responsables de la dégradation de l'isopropylbenzène. Les gènes définis ebdaabcdbc codent respectivement pour une dioxygénase périphérique, une cis-dihydrodiol deshydrogénase et une catéchol 2,3-dioxygénase toutes similaires à celles présentées chez les souches Pseudomonas re204, jr1 et ip01. Le meilleur inducteur de la voie ebd est l'ethylbenzène. Dans la dernière partie, l'influence de la température sur les capacités dégradatives a été étudiée. Les cinétiques de croissance ont montré que la souche 01g3 ainsi que les souches dégradant l'isopropylbenzène minéralisent les alkylbenzènes de 4 à 30\c. Ces quatre souches sont psychrotrophes, alors que la majorité des souches connues jusqu'alors.
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Text
n14:P1001
n15:T1009
rdaw:P10219
1999
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n11:1020