. "R\u00E8gles de coh\u00E9rence pour l'annotation g\u00E9nomique, d\u00E9veloppement et mise en \u0153uvre in silico et in vivo" . "R\u00E8gles de coh\u00E9rence pour l'annotation g\u00E9nomique, d\u00E9veloppement et mise en \u0153uvre in silico et in vivo" . . "Coherency rules for genome annotation, implementation, in silico and in vivo" . "L'annotation g\u00E9nomique identifie l'ensemble des \u00E9l\u00E9ments significatifs pr\u00E9sents sur l'ADN g\u00E9nomique, le support du programme de fonctionnement de l'organisme. Elle pr\u00E9dit leurs fonctions biologiques et leurs relations. L'annotation d'un g\u00E9nome complet est soumise \u00E0 diverses contraintes : elle doit \u00EAtre r\u00E9alis\u00E9e rapidement et repr\u00E9senter l'organisme comme syst\u00E8me biologique fonctionnel coh\u00E9rent. Nous proposons une m\u00E9thode de v\u00E9rification de la qualit\u00E9 de l'annotation g\u00E9nomique, bas\u00E9e sur un ensemble de r\u00E8gles de coh\u00E9rence d\u00E9finies d'apr\u00E8s les connaissances et contraintes biologiques admises par la communaut\u00E9 scientifique. Ces r\u00E8gles v\u00E9rifient la compl\u00E9tude de l'annotation (pr\u00E9sence des \u00E9l\u00E9ments vitaux pour l'organisme) et son absence d'erreur (sens biologique correct des \u00E9l\u00E9ments d\u00E9crits). Notre m\u00E9thode est appliqu\u00E9e dans le cadre du projet G\u00E9nolevures, un projet de g\u00E9nomique compar\u00E9e chez les levures h\u00E9miascomyc\u00E8tes. Nous avons mis en place un syst\u00E8me d'annotation facilitant le travail d'annotation manuelle par les experts. L'int\u00E9gration de nos r\u00E8gles dans ce syst\u00E8me permet de garantir la bonne qualit\u00E9 de l'annotation produite. Nous avons choisi de valider exp\u00E9rimentalement l'application de ces r\u00E8gles en \u00E9tudiant les interactions prot\u00E9ine-prot\u00E9ine chez les levures Saccharomyces cerevisiae et Yarrowia lipolytica par la technique de l'\u00E9lectrophor\u00E8se en gel de polyacrylamide en bleu natif et SDS (BN / SDS PAGE). Les r\u00E9sultats obtenus apportent de nouvelles connaissances chez les levures \u00E9tudi\u00E9es. Ils d\u00E9montrent l'universalit\u00E9 de certaines r\u00E8gles et le bien fond\u00E9 de la strat\u00E9gie d'annotation." . "Annotation" . . "Text" . "R\u00E8gles de coh\u00E9rence" . "G\u00E9nome" . . . "SDS" . "Interaction prot\u00E9ine-prot\u00E9ines" . "\u00C9lectrophor\u00E8se" . . "2008" . . "Bioinformatique" . "Electrophor\u00E8se BN" . . . . . . "Bio-informatique" . "Th\u00E8ses et \u00E9crits acad\u00E9miques" .