. . . "R\u00E9gulation (biologie)" . "R\u00E9gulation" . "Bacillus subtilis" . "ComK" . "Transfert g\u00E9n\u00E9tique" . "Identification of a new regulatory pathway for the K-State in bacillus subtilis" . "DegU" . "Identification of a new regulatory pathway for the K-State in bacillus subtilis" . . . "2017" . "Bacillus subtilis, a Gram-positive soil bacterium, can enter into several developmental pathways such as sporulation, biofilm formation and competence development for DNA transformation when it becomes limited for essential nutrients. During competence, cells do not divide, are tolerant to antibiotics and competent cells express more than a 100 genes. The competent state has been named the K-state after its master regulator ComK. In B. subtilis, the entry into the K-state is stochastically determined by the activation of the transcription factor ComK and occurs, in the domesticated strains of B. subtilis, in approximately 15% of the population. The emergence from genetically identical cells of two distinct subpopulations (competent cells and non-competent cells) is known to be a classic survival strategy for bacteria, known as bet-hedging. Regulation of entry into the K-state has been intensively studied and is well understood; however, the reasons why undomesticated isolates of B. subtilis are poorly transformable compared to the domesticated strains remained unexplained. We show here that fewer cells enter the K-state, suggesting that some regulatory pathway limiting its expression has been lost in the domesticated backgrounds. We demonstrate that this is largely due to an inactivating point mutation in the degQ promoter region resulting in a decrease of the amount of DegQ. DegQ is known to stimulate phosphate transfer from the DegS autokinase to its cognate response regulator DegU. A low level of DegQ thus decreases the concentration of the phosphorylated form of DegU, leading to the de-repression of the srfA operon, which increases the amount of ComS leading to the stabilization of ComK. Thus, in domesticated strains of B. subtilis, more cells reach the concentration threshold of ComK needed to activate the positive auto-regulatory loop of ComK acting on its own promoter. We also show that the activation of srfA transcription in undomesticated strains is transient, as it is turned off when cells enter the stationary phase. Taken together, these data indicate that the K-state and transformability are less frequent and more transient in the undomesticated strains of B. subtilis. Consideration of the regulatory mechanisms and the fitness advantages and costs of the K-state must from now on take these features into consideration. These results underscore that our understanding of real-life biology requires the use of wild isolates." . . "Comp\u00E9tence" . . . "Identification d\u2019une nouvelle voie de regulation du K-state chez Bacillus subtilis" . . . . "Th\u00E8ses et \u00E9crits acad\u00E9miques" . . "Text" . . . "Bacillus subtilis, une bact\u00E9rie Gram-positive pr\u00E9sente dans le sol, peut lorsque les nutriments sont en concentrations limitantes, sporuler, former des biofilms ou devenir comp\u00E9tente. La comp\u00E9tence est, chez B. subtilis, caract\u00E9ris\u00E9e par un arr\u00EAt de la division cellulaire, une tol\u00E9rance aux antibiotiques et l'expression de plus d'une centaine de g\u00E8nes. L'expression de la comp\u00E9tence, aussi d\u00E9sign\u00E9e sous le nom de \\\" K-state \\\", est d\u00E9pendante de la synth\u00E8se du facteur de transcription ComK et se fait de fa\u00E7on stochastique r\u00E9sultant en la formation de deux sous-populations bact\u00E9riennes, non-comp\u00E9tentes et comp\u00E9tentes. L'\u00E9mergence, \u00E0 partir de cellules g\u00E9n\u00E9tiquement identiques, de deux sous-populations distinctes est une strat\u00E9gie de survie tr\u00E8s r\u00E9pandue chez les procaryotes, connue sous le nom de \\\" bet-hedging \\\". Bien que les m\u00E9canismes de r\u00E9gulation du d\u00E9veloppement de la comp\u00E9tence ont, chez B. subtilis, largement \u00E9t\u00E9 \u00E9tudi\u00E9s au cours des derni\u00E8res ann\u00E9es, la raison pour laquelle les souches non-domestiques sont tr\u00E8s peu transformables (1-2% de la population) compar\u00E9 aux souches domestiques (~15%) reste m\u00E9connue. Nous d\u00E9montrons ici que c'est essentiellement d\u00FB \u00E0 une mutation de transition dans le promoteur du g\u00E8ne degQ. Cette mutation diminue la synth\u00E8se de DegQ, prot\u00E9ine impliqu\u00E9e dans la r\u00E9gulation de la formation de biofilms, de la synth\u00E8se d'exoprot\u00E9ases et de la transformation g\u00E9n\u00E9tique. DegQ est une prot\u00E9ine impliqu\u00E9e dans le transfert d'un groupe phosphoryl entre la kinase DegS et son substrat DegU. Une faible quantit\u00E9 de DegQ diminue la concentration en DegU~P ce qui a pour cons\u00E9quence la d\u00E9sinhibition de l'op\u00E9ron srfA entrainant une accumulation de ComK et l'expression de la comp\u00E9tence. C'est ainsi que, dans les souches domestiques de B. subtilis, un plus grand nombre de bact\u00E9ries atteignent le niveau n\u00E9cessaire en ComK pour activer une boucle d'auto-activation transcriptionnelle de comK. Nous d\u00E9montrons aussi que l'activation transcriptionnelle de srfA est, dans les souches non-domestiques, transitoire alors que la population bact\u00E9rienne entre en phase stationnaire de croissance. Ces donn\u00E9es indiquent que le d\u00E9veloppement de la comp\u00E9tence est moins fr\u00E9quent et plus transitoire dans les souches non-domestiques de B. subtilis. De plus, cette limitation du K-state dans les souches non-domestiques est plus importante que pr\u00E9c\u00E9demment \\\" pens\u00E9 \\\" probablement d\u00FB \u00E0 la domestication de B. subtilis au cours de ces 50 derni\u00E8res ann\u00E9es. Ce travail refl\u00E8te non seulement, l'importance de l'utilisation de souches non-domestiques dans la caract\u00E9risation des voies de r\u00E9gulation de la comp\u00E9tence chez B. subtilis, mais aussi la port\u00E9e du choix de mod\u00E8le biologique dans l'\u00E9tude de ph\u00E9nom\u00E8nes biologiques complexes." . "DNA transformation" .